76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0189 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  73.71 
 
 
240 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  75.22 
 
 
240 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  62.67 
 
 
242 aa  279  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  52.84 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  43.44 
 
 
247 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  42.99 
 
 
247 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  42.99 
 
 
247 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  43.44 
 
 
247 aa  175  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  42.08 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  42.41 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  42.2 
 
 
243 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  41.44 
 
 
245 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  42.53 
 
 
247 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  44.02 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  42.08 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  42.08 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  41.63 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  42.53 
 
 
246 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  40.71 
 
 
242 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  42.08 
 
 
244 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  40.68 
 
 
246 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  41.3 
 
 
243 aa  148  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  36.92 
 
 
241 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  34.76 
 
 
241 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  34.84 
 
 
238 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  33.18 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  35.4 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  34.27 
 
 
240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  36.46 
 
 
235 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  31.65 
 
 
241 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  32.04 
 
 
251 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.77 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  33.48 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  30.26 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  38.57 
 
 
174 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  31.94 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  32.84 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  32.26 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  29.36 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  33.49 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26.96 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  28 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  28 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  23.02 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  28.99 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.24 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  28.41 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  28.41 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  28.41 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  27.31 
 
 
247 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  31.19 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  30.26 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  28.4 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  27.84 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  29.52 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5048  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.51 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.51 
 
 
253 aa  46.6  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03786  putative integral membrane protein  28.51 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5696  protein of unknown function DUF81  26.45 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6207  hypothetical protein  32.04 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449503  normal  0.698789 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  24.88 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  29.34 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  29.34 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  24.79 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  28.93 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  26.75 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  26.05 
 
 
255 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3771  hypothetical protein  27.83 
 
 
256 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  25.18 
 
 
262 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.82 
 
 
252 aa  41.6  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>