44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3303 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  487  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  34.67 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  32.38 
 
 		 247 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  32.91 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  31.97 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  31.97 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  31.97 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  31.97 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  31.62 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  31.62 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  31.2 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  31.03 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  33.48 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  33.8 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  37.33 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  36.52 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  32.03 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  32.43 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  29.66 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  29.36 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  33 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  29.6 
 
 		 241 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  30.53 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  30.17 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  32.05 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  34.31 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  29.58 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  30.22 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  32.84 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  36.9 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  29.96 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  30.62 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  32.89 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  30.5 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  32.43 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  30.93 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  39.35 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  31.63 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  31.55 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.85 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  29.02 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  24.24 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>