62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3856 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  461  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  35.68 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  37.61 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  34.93 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  35.78 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  36.92 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  33.99 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  37.44 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  35.05 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  33.62 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  33.62 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  32.76 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  33.62 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  33.19 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  32.2 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  32.33 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  35.92 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  31.91 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  31.91 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  31.91 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  32.51 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  37.91 
 
 		 244 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  33.64 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  35.43 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  35.43 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  32.11 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  35.29 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  31.78 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  36.68 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  35.9 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  30.45 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  35.06 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  31.94 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  34.7 
 
 		 239 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  29.82 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  30.17 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  28.44 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  85.1  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  29.15 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.7 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.05 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  25.45 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  26.91 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  27.95 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  27.03 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  30.94 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  27.51 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  29.13 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  27.51 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  27.51 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  27.95 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  30.33 
 
 		 247 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  29.28 
 
 		 245 aa  45.4  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  27.78 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  27.72 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  26.01 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  23.95 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  27.75 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  25.71 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.63 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>