54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4529 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  447  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  51.27 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  54.47 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  34.84 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  38.5 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  34.96 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  36 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  33.18 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  30.38 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  32.09 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  35.27 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  31.78 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  29.71 
 
 		 240 aa  95.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  32.99 
 
 		 261 aa  95.1  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  28.07 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  29.82 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  34.8 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  29.78 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  24.76 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  30.73 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  26.36 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  34.72 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  24.64 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  26.34 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  25.89 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  27.78 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  25.45 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  30.56 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  25.45 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  25.45 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  25.45 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  26.57 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  25.45 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  25.23 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  26.4 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  32.27 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  32.14 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  21.14 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  23.08 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  19.91 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  22.57 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  35.48 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  22.03 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.44 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  24.15 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  24.15 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  24.15 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  19.09 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  26.75 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  21.8 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>