45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4204 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  329  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  56.6 
 
 		 240 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  49.68 
 
 		 241 aa  121  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  41.03 
 
 		 238 aa  98.2  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  41.67 
 
 		 242 aa  97.8  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  95.5  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  38.06 
 
 		 242 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  33.77 
 
 		 244 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  35.71 
 
 		 241 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  34.19 
 
 		 247 aa  85.5  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  34.97 
 
 		 245 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  37.11 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  38.57 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  35 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  37.93 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  35.48 
 
 		 247 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  48 
 
 		 268 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  34.84 
 
 		 243 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  41.22 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  36.57 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  32.47 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  32.3 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  34.16 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  34.84 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  34.84 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  34.84 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  34.51 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  31.17 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  31.82 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  31.82 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  36.13 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  43.12 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  39.87 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  35.95 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  38.66 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  39.35 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  34.43 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  31.65 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  32.14 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  28.44 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  27.1 
 
 		 248 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  33.6 
 
 		 247 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  26.35 
 
 		 254 aa  40.8  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>