72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0613 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  76.03 
 
 		 247 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  73.86 
 
 		 247 aa  364  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  75.52 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  73.86 
 
 		 247 aa  363  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  73.44 
 
 		 247 aa  361  6e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  77.27 
 
 		 247 aa  358  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  76.76 
 
 		 244 aa  358  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  76.86 
 
 		 247 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  76.86 
 
 		 247 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  76.45 
 
 		 247 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  74.9 
 
 		 243 aa  353  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  75.21 
 
 		 246 aa  327  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  77.18 
 
 		 244 aa  322  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  69.14 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  70.89 
 
 		 246 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  44.25 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  42.22 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  39.75 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  36.28 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  35.4 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  35.9 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  33.47 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  32.9 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  36.91 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  34.17 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.92 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  33.04 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  31.33 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  32.57 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  30.3 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  32.9 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  37.11 
 
 		 174 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  30.21 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  30.8 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  26.47 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  26.13 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  32.85 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  34.26 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  29.19 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  30.24 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.59 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  27.71 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  29.91 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  23.08 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  29.49 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  25.78 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  25.43 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  28.91 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  28.81 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.99 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  24.57 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  24.38 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  24.38 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  24.57 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  31.08 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  24.14 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  24.14 
 
 		 241 aa  45.4  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  24.14 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  24.14 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  24.68 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.33 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  23.17 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  29.12 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  30.43 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  24.68 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  27.43 
 
 		 245 aa  42  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>