117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2351 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 251 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  59.92 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  38.61 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  31.09 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  31.53 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  32.44 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  31.78 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  31.53 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  32.24 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  32.04 
 
 		 245 aa  92.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  29.66 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  29.66 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  28.39 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  31.08 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.39 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  30.93 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  27.97 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  29.29 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  28.02 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  28.02 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  28.02 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  27.54 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  26.61 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  28.24 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  28.86 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  26.09 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  24.54 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  26.11 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  28.38 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  32.72 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  32.37 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  24 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  23 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1041  protein of unknown function DUF81  25.54 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0163787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  29.91 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  26.94 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  26.75 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  27.19 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  26.94 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  24.57 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  30.04 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  25.81 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  27.23 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  25.51 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.05 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  25.81 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  25.81 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  25.94 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  28.83 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  26.56 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  27.98 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  27.89 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  26.25 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  24.12 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.13 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  27.7 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  21.4 
 
 		 257 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  24.62 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  27.68 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  24.24 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  24.24 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  25 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.32 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  27.05 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  25.43 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  25.53 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  23.89 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  24.29 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  26.67 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  24.15 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  22.36 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30.67 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  22.36 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  24.73 
 
 		 343 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  27.49 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30.49 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  27.68 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  23.89 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  21.95 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  25.32 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  24.28 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  24.89 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  24.73 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  24.89 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  25.42 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  25.42 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  25.42 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  29.19 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  27.51 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  31.45 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  29.11 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  28.02 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  24.68 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  27.67 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>