60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0252 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
249 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  35.47 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
254 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  29.82 
 
 
255 aa  99  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  29.1 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  28.95 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  23.35 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  27.5 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  28.82 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  21.88 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  21.74 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  25.1 
 
 
267 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  21.67 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  21.4 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  21.99 
 
 
250 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  25.4 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  25.4 
 
 
247 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  25.49 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  27.52 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  25.4 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  21.82 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  24.66 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  22.81 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  22.59 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  28.83 
 
 
245 aa  48.9  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  22.87 
 
 
249 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  26.17 
 
 
247 aa  48.9  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  20.55 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  20.55 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  22.89 
 
 
257 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  22.27 
 
 
245 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  20.72 
 
 
261 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  22.42 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  20 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  20.09 
 
 
309 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  24.2 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  20.96 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  26.42 
 
 
262 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  25.23 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  24.2 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1932  protein of unknown function DUF81  23.91 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  23.58 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  19.63 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  29.17 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  21.1 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  21.65 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  22.27 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  26.16 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  17.97 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  19.3 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  26.61 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  27.31 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  27.38 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  27.31 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  26.24 
 
 
238 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>