86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0205 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
254 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  49.6 
 
 
255 aa  214  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  43.59 
 
 
257 aa  175  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  42.32 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  32.51 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  32.51 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  32.51 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  27.59 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  29.74 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  26.86 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  31.58 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  29.66 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  27.63 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  31.1 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  32.07 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  29.05 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  29.06 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  29.24 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  27.94 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  28.99 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  28.16 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  30.51 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  28.81 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  31.33 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  28.02 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  27.97 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  28.92 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  28.23 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  27.82 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  28.81 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  27.06 
 
 
260 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  26.94 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  26.72 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  31.78 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  32.88 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  29.47 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  30 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  26.95 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  26.21 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  25.54 
 
 
245 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  25.54 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  25.54 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  25.54 
 
 
245 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  23.46 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  25.1 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  29.87 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  31.97 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  25.73 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25.61 
 
 
309 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2024  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396668  normal  0.0591457 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  27.53 
 
 
252 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  24.21 
 
 
307 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  28.93 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  27.04 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  27.31 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  26.14 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  26.32 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  27.83 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  27.73 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  27.78 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  30.17 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  26.09 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  25.32 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  29.05 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  28.1 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  25.57 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  25.81 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  26.42 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  28.1 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  23.16 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  28.1 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  26.85 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  26.85 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  26.85 
 
 
245 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  25.48 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  25.95 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  27.14 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  25.95 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  25.82 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  28.24 
 
 
255 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  30.11 
 
 
255 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>