25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0154 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0154  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  480  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.418576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  35.27 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  28.64 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  28.76 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  27.52 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2327  hypothetical protein  33.8 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.042109  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  24.02 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  29.09 
 
 		 250 aa  48.5  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  33.77 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  26.29 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26.2 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  24.3 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  24.7 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  24.7 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  24.7 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  29.46 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  22.32 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  24.58 
 
 		 244 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  23.38 
 
 		 247 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  25.24 
 
 		 263 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>