65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6144 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  72.13 
 
 
259 aa  331  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  70.78 
 
 
250 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  68.85 
 
 
261 aa  324  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  67.21 
 
 
261 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  63.67 
 
 
250 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  43.75 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  47.08 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  47.75 
 
 
250 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  47.27 
 
 
250 aa  191  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  47.73 
 
 
250 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  43.93 
 
 
243 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  45.91 
 
 
251 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  48.62 
 
 
250 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  45 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  45 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  45 
 
 
249 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  44.49 
 
 
248 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  44.17 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  40.43 
 
 
238 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  43.75 
 
 
254 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  42.06 
 
 
230 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  45 
 
 
258 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  43.75 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  43.59 
 
 
254 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  42.68 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  45.64 
 
 
254 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  48 
 
 
250 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  44.58 
 
 
267 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  44.58 
 
 
246 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  42.21 
 
 
249 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  43.75 
 
 
267 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  41.74 
 
 
241 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  42.62 
 
 
258 aa  154  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  41.53 
 
 
278 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  41.3 
 
 
241 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  41.05 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  42.01 
 
 
252 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  44.74 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  41.15 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  43.02 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  39.57 
 
 
256 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  36.76 
 
 
256 aa  99  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  66 
 
 
61 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.63 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  26.47 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  29.96 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  20.75 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  28.69 
 
 
241 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  29.96 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25.53 
 
 
309 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  27.54 
 
 
245 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  28.88 
 
 
227 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  27.54 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  27.54 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  21.43 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  28.18 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  30.94 
 
 
240 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  26.61 
 
 
255 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>