45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3491 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  33.19 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  31.51 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  32.31 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  29.6 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  29.6 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  34.44 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  33.94 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  29.36 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  34.7 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  29.54 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  30.6 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  34.98 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  28.51 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  30.6 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  28.51 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  28.12 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  32.59 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  29.63 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  35.04 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.54 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  18.61 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  27.4 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  26.03 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.33 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  21.09 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  29.22 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  24.02 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  24.02 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  24.02 
 
 		 291 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  29.6 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  21.52 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  24.24 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  24.75 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  21 
 
 		 241 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  26.83 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  25.76 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  26.73 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  25.76 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5048  protein of unknown function DUF81  30.91 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  26.34 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  26.34 
 
 		 252 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  20.09 
 
 		 239 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  20.09 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>