27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0039 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  68.15 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  66.67 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  72.1 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  65.04 
 
 		 250 aa  288  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  65.07 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  66.39 
 
 		 249 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  64.58 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  59.6 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  98.65 
 
 		 247 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  65.07 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  45.02 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  57.93 
 
 		 146 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  34.55 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  29.83 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  29.83 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  34.89 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  31.3 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  33.49 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.43 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  25.64 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  29.38 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  29.38 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  26.78 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  29.05 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.55 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>