44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0977 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  29.71 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  30.77 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  27.2 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  23.65 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  26.61 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  26.61 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  26.61 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  26.61 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.79 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  29.22 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  24.27 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  29.7 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  24.53 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  27.4 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  27.37 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  24.79 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  23.28 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  22.32 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  25.47 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  28.22 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  25.91 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  22.9 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  25.86 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  26.59 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  25.73 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  25.4 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  24.17 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  29.81 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  24.52 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  22.65 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  21.98 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  28.07 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  25 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  26.92 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  24.28 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  24.69 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  32.28 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  26.13 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  25.23 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 		 252 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  27.82 
 
 		 240 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>