50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4638 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  82.73 
 
 		 282 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  65.91 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  65.15 
 
 		 264 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5394  hypothetical protein  65.71 
 
 		 117 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.030733 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4487  hypothetical protein  64.52 
 
 		 79 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3882  hypothetical protein  64.52 
 
 		 79 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  29.64 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  33.91 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5817  hypothetical protein  61.82 
 
 		 59 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  27.12 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  25.86 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  31.74 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  29.39 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  31.3 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  27.88 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  30.32 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  26.56 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  27.65 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  27.65 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  25.43 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  30.59 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  24.69 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  28.25 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  29.39 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  29.39 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  29.39 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  25.61 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  27.6 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  25.93 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  32.33 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  27.24 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  23.28 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  27.43 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  30 
 
 		 267 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  26.94 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  25.79 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  31.97 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  31.4 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  20.25 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>