54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1367 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  82.73 
 
 
309 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  70.83 
 
 
264 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  70.83 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5394  hypothetical protein  63.29 
 
 
117 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.030733 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4487  hypothetical protein  64.52 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3882  hypothetical protein  64.52 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  32.31 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5817  hypothetical protein  63.64 
 
 
59 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  28.18 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  30.53 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  30.32 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  30.32 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  28.69 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  33.09 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  28.12 
 
 
238 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  27.07 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  30.04 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  29.22 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  33.19 
 
 
258 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  24.55 
 
 
261 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  25.46 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  26.61 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  29.15 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  26.61 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  26.61 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  25.89 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  27.52 
 
 
267 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  25.76 
 
 
250 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  23.66 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  28.38 
 
 
241 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  25.23 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  29.52 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  34.71 
 
 
267 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  29.07 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  25.45 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  28.83 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  31.3 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  24.28 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  28.69 
 
 
250 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  25.22 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  26.58 
 
 
241 aa  45.8  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  29.02 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  37.65 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  24.55 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  26.79 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  21.56 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  23.4 
 
 
255 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  24.38 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>