53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2134 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  471  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  53.6 
 
 
251 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  49.58 
 
 
241 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  50.63 
 
 
254 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  48.95 
 
 
241 aa  190  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  48.99 
 
 
243 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  51.69 
 
 
250 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  52.12 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  51.69 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  50.42 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  46.84 
 
 
230 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  50.21 
 
 
254 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  46.19 
 
 
238 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  50.84 
 
 
254 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  52.1 
 
 
250 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  46.67 
 
 
249 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  46.67 
 
 
249 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  46.67 
 
 
249 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  46.15 
 
 
251 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  44.3 
 
 
261 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  49.32 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  45 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  46.67 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  42.62 
 
 
244 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  50.2 
 
 
270 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  46.86 
 
 
267 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  47.73 
 
 
251 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  51.85 
 
 
250 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  46.25 
 
 
246 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  43.28 
 
 
261 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  46.72 
 
 
251 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  45.9 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  42.31 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  43.04 
 
 
250 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  43.83 
 
 
259 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  45.8 
 
 
278 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  45.13 
 
 
252 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  46.05 
 
 
256 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  45.74 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  44.36 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  47.02 
 
 
256 aa  92.4  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  32.33 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  31.3 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  37.97 
 
 
123 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  27.69 
 
 
257 aa  55.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.64 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  60.47 
 
 
61 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  32.61 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  49.3  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  36.71 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.6 
 
 
254 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>