44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3052 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  239  9e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 
250 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  45.63 
 
 
251 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  41.58 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  40.87 
 
 
248 aa  80.5  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  36.13 
 
 
251 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  33.9 
 
 
261 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  44.09 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  33.05 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  35.04 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  40.83 
 
 
254 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  35.04 
 
 
250 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  35.04 
 
 
250 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  30.51 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  40 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  33.05 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  45.07 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  46.15 
 
 
254 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  45.83 
 
 
267 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  40.17 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  46.15 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  38.96 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  40.17 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  36.45 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  40.17 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  38.66 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  46.38 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  33.05 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  32.2 
 
 
259 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  40.28 
 
 
241 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  38.46 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  41.67 
 
 
241 aa  63.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  35.96 
 
 
258 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  43.06 
 
 
250 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  54 
 
 
267 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  54 
 
 
246 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  54 
 
 
267 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  36.27 
 
 
270 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  52.73 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  48.94 
 
 
61 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.31 
 
 
254 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  41.18 
 
 
256 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>