59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2113 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  93 
 
 		 243 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  57.08 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  54.04 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  58.88 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  56.72 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  57.74 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  57.73 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  54.91 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  56.05 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  53.42 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  56.05 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  52.99 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  54.7 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  56.41 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  51.74 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  51.74 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  51.74 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  45.96 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  48.89 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  52.61 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  48.31 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  53.42 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  49.34 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  53.04 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  43.51 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  52.17 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  43.1 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  52.17 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  41.84 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  50.69 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  51.11 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  42.68 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  40.34 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  42.49 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  47.77 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  55.91 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  47.08 
 
 		 278 aa  164  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  47.25 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  45.87 
 
 		 258 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  49.16 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  46.72 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  47.4 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  29.96 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  44.87 
 
 		 123 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  27.92 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  62 
 
 		 61 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  61.82 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25.34 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  25.78 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  22.22 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  24.27 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  24.89 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  24.27 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  17.74 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  27.6 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  21.7 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>