57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4663 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  470  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  98.82 
 
 		 254 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  93.31 
 
 		 254 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  87.4 
 
 		 258 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  67.32 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  67.63 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  58.45 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  58.55 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  63.32 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  53.42 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  58.12 
 
 		 249 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  58.12 
 
 		 249 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  58.12 
 
 		 249 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  56.62 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  61.01 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  54.75 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  56.88 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  55.96 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  51.93 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  55.08 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  55.04 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  52.84 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  55.88 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  55.88 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  55.46 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  59.09 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  55.04 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  49.36 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  53.48 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  52.99 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  43.2 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  53.39 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  45.99 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  44.3 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  54.27 
 
 		 278 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  44.54 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  62.22 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  42.98 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  50 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  43.75 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  51.1 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  47.84 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  48.29 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  75.93 
 
 		 61 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.38 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  31.74 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  54.69 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  30.04 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  27.04 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  25.12 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  24.58 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  28.25 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  19.31 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  27.7 
 
 		 264 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>