56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0685 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  49.03 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  49.03 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  49.03 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  51.42 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  49.8 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  51.65 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  50.81 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  50.63 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  47.3 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  51.91 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  47.67 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  47.37 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  47.37 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  41.73 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  46.64 
 
 		 230 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  42.29 
 
 		 261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  48.1 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  48.52 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  48.95 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  43.33 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  48.12 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  42.52 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  46.84 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  47.6 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  47.75 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  41.94 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  46.22 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  43.09 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  44.63 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  47.35 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  47.98 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  47.76 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  44.59 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  42.51 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  46.67 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  45.54 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  42.49 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  43.03 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  43.98 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  44.1 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  43.24 
 
 		 194 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.69 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  44.29 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  26.44 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  60 
 
 		 61 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  25.97 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  26.69 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  38.57 
 
 		 83 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  25.94 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  20.59 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  27.4 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25.63 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  34.15 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>