56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4272 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
251 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  84.36 
 
 
250 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  69.36 
 
 
250 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  69.07 
 
 
250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  69.36 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  57.5 
 
 
243 aa  241  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  61.61 
 
 
251 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  58.55 
 
 
254 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  56.07 
 
 
249 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  56.07 
 
 
249 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  56.07 
 
 
249 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  57.69 
 
 
254 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  59.74 
 
 
258 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  52.14 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  57.08 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  58.12 
 
 
254 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  55.08 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  52.56 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  62.11 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  48.37 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  49.59 
 
 
251 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 
241 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  55.65 
 
 
267 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  55.65 
 
 
246 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  54.25 
 
 
267 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  54.04 
 
 
241 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  56.38 
 
 
270 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  53.92 
 
 
248 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  54.74 
 
 
254 aa  205  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  47.2 
 
 
261 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  46.96 
 
 
250 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  47.58 
 
 
250 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  47.08 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  50.2 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  51.05 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  54.89 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  57.4 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  52.61 
 
 
258 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  50.68 
 
 
252 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  56.67 
 
 
194 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  45.27 
 
 
258 aa  131  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  47.41 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  46.98 
 
 
256 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  46.43 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  78.85 
 
 
61 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  30.34 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  31.1 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  28.75 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  28.83 
 
 
309 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  53.97 
 
 
83 aa  55.5  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  27.31 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  28.23 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  26.81 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
264 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>