55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2576 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  488  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  49.59 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  49.59 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  49.59 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  45.99 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  46.12 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  44.12 
 
 		 238 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  48.35 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  43.46 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  49.58 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  49.17 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  46.06 
 
 		 243 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  42.8 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  46.58 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  47.84 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  45.05 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  47.84 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  42.44 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  46.86 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  50 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  42.17 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  42.41 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  45.27 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  50.68 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  53.67 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  41.15 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  45.87 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  43.2 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  43.75 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  43.55 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  46.55 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  46.03 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  46.61 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  41.81 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  41.81 
 
 		 250 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  43.14 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  41.38 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  38.79 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  47.51 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  42.42 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  42.31 
 
 		 194 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  43.35 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  58.62 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  28.69 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  29.29 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  30.4 
 
 		 284 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  27.71 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  41.89 
 
 		 123 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  30.13 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  53.85 
 
 		 83 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  30.17 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  18.02 
 
 		 253 aa  45.4  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1932  protein of unknown function DUF81  30.38 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>