58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3331 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
241 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  92.92 
 
 
241 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  70.17 
 
 
238 aa  324  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  69.23 
 
 
230 aa  315  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  66.11 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  66.11 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  66.11 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  64.58 
 
 
267 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  65 
 
 
267 aa  294  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  64.58 
 
 
246 aa  291  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  64.85 
 
 
267 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  54.58 
 
 
254 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  54.17 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 
251 aa  215  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  54.17 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  49.78 
 
 
243 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  52.92 
 
 
254 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  55.45 
 
 
250 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  52.08 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  55.09 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  51.46 
 
 
270 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  49.77 
 
 
250 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  47.73 
 
 
248 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  47.48 
 
 
251 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  49.08 
 
 
250 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  49.08 
 
 
250 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  53.67 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  49.34 
 
 
251 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  47.62 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  42.32 
 
 
250 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  43.83 
 
 
261 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  49.16 
 
 
258 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  43.48 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  47.92 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  42.61 
 
 
250 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  48.43 
 
 
252 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  44.02 
 
 
258 aa  165  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  41.74 
 
 
244 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  52.02 
 
 
254 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  51.4 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  47.19 
 
 
256 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  40 
 
 
259 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  48.25 
 
 
256 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  29.31 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  40.28 
 
 
123 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  71.11 
 
 
61 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25.79 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  27.27 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  26.58 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  52.63 
 
 
83 aa  48.9  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.69 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  26.56 
 
 
257 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  21.4 
 
 
249 aa  45.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  21.99 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  31.76 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  21.58 
 
 
257 aa  42.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>