40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1090 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  488  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  59.76 
 
 
254 aa  271  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  28.16 
 
 
253 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  29.66 
 
 
249 aa  87  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  33.48 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  32.9 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  29.68 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 
264 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  28.27 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  27.9 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  26.67 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  26.32 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  29.55 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  28.31 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  26.2 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  28 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.85 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  29.13 
 
 
254 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  32.14 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  27.71 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  27.11 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  25.58 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  28.45 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  31.03 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  27.71 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  28.02 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  26.99 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  26.72 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2024  hypothetical protein  26.95 
 
 
251 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396668  normal  0.0591457 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  25.11 
 
 
249 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1932  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  27.83 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  34.52 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 
250 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 
250 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>