76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1292 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
248 aa  473  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  60.32 
 
 
249 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  56.41 
 
 
251 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  55.7 
 
 
243 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  53.75 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  57.58 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  53.81 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  53.39 
 
 
254 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  53.42 
 
 
251 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  47.23 
 
 
238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  55.27 
 
 
254 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  53.39 
 
 
250 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  53.39 
 
 
250 aa  208  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  52.97 
 
 
250 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  50 
 
 
249 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  52.72 
 
 
254 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  45.3 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  55.05 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  54.88 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  50 
 
 
246 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  48.29 
 
 
267 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  49.15 
 
 
267 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  48.72 
 
 
267 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  49.15 
 
 
278 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  47.26 
 
 
241 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  47.5 
 
 
241 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  44.81 
 
 
244 aa  185  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  48.15 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  51.77 
 
 
250 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  54.02 
 
 
254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  41.15 
 
 
250 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  41.45 
 
 
261 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  48.32 
 
 
258 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  41.88 
 
 
261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  43.78 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  40.25 
 
 
250 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  44.35 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  53.67 
 
 
194 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  44.55 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  42.92 
 
 
256 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  31.73 
 
 
254 aa  89  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  30.04 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  39.65 
 
 
256 aa  82  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  46.43 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  27.43 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  28.14 
 
 
309 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  59.02 
 
 
83 aa  63.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  26.45 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  28.11 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  19.73 
 
 
253 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  26.21 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  61.36 
 
 
61 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  28.29 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.41 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  25.65 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  25.65 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  25.65 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  26.41 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  26.41 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  26.41 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  31.39 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  31.39 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  31.39 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2024  hypothetical protein  24.78 
 
 
251 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396668  normal  0.0591457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  24.47 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  23.81 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  23.36 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  29.2 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  29.58 
 
 
260 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  30.97 
 
 
241 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  30.97 
 
 
241 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>