57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0773 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  87.4 
 
 
254 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  86.22 
 
 
254 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  84.65 
 
 
254 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  68.9 
 
 
254 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  67.63 
 
 
254 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  59.74 
 
 
251 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  55.04 
 
 
248 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  58.06 
 
 
270 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  57.69 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  57.69 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  57.69 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  57.99 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  58.72 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  57.8 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  57.14 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  57.32 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  58.99 
 
 
251 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  51.07 
 
 
238 aa  211  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  54.17 
 
 
241 aa  211  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  53.48 
 
 
230 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  61.19 
 
 
250 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  57.14 
 
 
246 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  57.14 
 
 
267 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  56.72 
 
 
267 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  54.85 
 
 
241 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  55.46 
 
 
249 aa  205  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  49.36 
 
 
251 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  45.15 
 
 
250 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  53.42 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  54.7 
 
 
278 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  42.58 
 
 
261 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  54.38 
 
 
252 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  45.61 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  43.51 
 
 
261 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  45.83 
 
 
244 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  44.73 
 
 
250 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  50.42 
 
 
258 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  58.1 
 
 
194 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  48.02 
 
 
256 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  47.44 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  32.07 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  34.43 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  29.05 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  72.22 
 
 
61 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  46.15 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  33.19 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  56.25 
 
 
83 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  25.11 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  27.9 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  30.7 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  27.47 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  30.1 
 
 
307 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  19.83 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>