55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2443 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  62.82 
 
 
270 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  64.22 
 
 
252 aa  233  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  55.56 
 
 
254 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  54.7 
 
 
254 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  51.26 
 
 
230 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  54.27 
 
 
254 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  54.7 
 
 
258 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  54.89 
 
 
251 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  48.32 
 
 
238 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  52.34 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  52.34 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  52.34 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  54.88 
 
 
251 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  49.32 
 
 
248 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  53.42 
 
 
267 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  51.52 
 
 
267 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  52.84 
 
 
267 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  51.52 
 
 
246 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  48.07 
 
 
251 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  48.31 
 
 
243 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  51.93 
 
 
254 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  52.84 
 
 
250 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  53.28 
 
 
250 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  56.33 
 
 
250 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  52.84 
 
 
250 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  48.16 
 
 
241 aa  185  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  47.13 
 
 
241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  49.79 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  42.92 
 
 
261 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  43.22 
 
 
250 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  43.33 
 
 
261 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  42.31 
 
 
244 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  53.6 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  52.02 
 
 
254 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  53.04 
 
 
256 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  46.18 
 
 
251 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  45.68 
 
 
258 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  44.35 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  42.74 
 
 
250 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  46.44 
 
 
258 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  48.9 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  48.51 
 
 
256 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  46.38 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.38 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  75 
 
 
61 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  28.96 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  31.14 
 
 
264 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  26.72 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  23.85 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  54.72 
 
 
83 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.33 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  28.91 
 
 
257 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  26.78 
 
 
282 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>