77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1633 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  59.41 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  59.83 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  55.88 
 
 		 243 aa  238  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  56.72 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  56.33 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  54.35 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  55.46 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  53.48 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  51.05 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  46.32 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  46.35 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  51.97 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  51.95 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  50.22 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  50.21 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  49.79 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  50.64 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  43.44 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  43.44 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  43.44 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  47.62 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  45.87 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  47.19 
 
 		 241 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  45.68 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  45.57 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  45.45 
 
 		 267 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  51.98 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  49.79 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  47.47 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  42.56 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  55.75 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  40.25 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  47.71 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  41.08 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  41.74 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  45.68 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  42.86 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  38.03 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  49.72 
 
 		 194 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  43.2 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  42.92 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  39.71 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  30.9 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  32.31 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.54 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  44.05 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  57.97 
 
 		 83 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  30.83 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  61.54 
 
 		 61 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  27.73 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  29.66 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  28.84 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.31 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  26.52 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  29.11 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  25.2 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  24.39 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  17.65 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  22.22 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2024  hypothetical protein  25.12 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396668  normal  0.0591457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  24.24 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  30.83 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  24.24 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  24.89 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  24.24 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  25.79 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  27.87 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  22.98 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  32.73 
 
 		 117 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  34.53 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  25 
 
 		 247 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  30.25 
 
 		 248 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  24.68 
 
 		 245 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>