24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2117 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  93.7 
 
 
257 aa  471  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  70.4 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  31.44 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  25.56 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.06 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  27.71 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  28.38 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  26.09 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  27.31 
 
 
258 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  27.31 
 
 
232 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  29.14 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  27.94 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  25.2 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  24.47 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  33.68 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  24.03 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  24.38 
 
 
282 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25.3 
 
 
309 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>