75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2445 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  49.6 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  47.97 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  39.37 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  30.9 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  31.86 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  31.69 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  31.42 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  28.93 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  30.18 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  29.33 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  27.86 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  30.33 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  30.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  30.8 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  29.96 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  28.99 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  30.64 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  27.63 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  29.44 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  29.54 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  29.54 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  29.54 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.48 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  30.4 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  30.14 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  25.56 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  28.85 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  31.05 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  26.32 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  26.07 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  31.72 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  31.72 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  26.23 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  29.6 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  26.64 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.35 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  28.14 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  31.84 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  22.55 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  25.21 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  29.29 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  25.3 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  26.67 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  26.91 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  24.61 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  26.67 
 
 		 177 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  26.47 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  27.63 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  26.67 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  28.7 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  28.7 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  28.7 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  26 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2024  hypothetical protein  22.86 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396668  normal  0.0591457 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  25.69 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  27.24 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  25.31 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  28.07 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  29.92 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  31.78 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  24.46 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  27.24 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  28.68 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  26.23 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  26.61 
 
 		 272 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>