24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3800 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2024  hypothetical protein  47.81 
 
 
251 aa  187  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396668  normal  0.0591457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  31.47 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  26.11 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  29.46 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  26.47 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  27.8 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  30.54 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  24.47 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  26.8 
 
 
246 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  24.67 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  27.31 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  27.73 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  26.47 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  38.98 
 
 
301 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  35.54 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  22.22 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  32.76 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  26.67 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  25.13 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  22.47 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  25.65 
 
 
227 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
270 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>