71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4361 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  88.98 
 
 		 261 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  82.26 
 
 		 250 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  73.26 
 
 		 259 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  67.21 
 
 		 244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  62.9 
 
 		 250 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  48.37 
 
 		 251 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  46.96 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  46.93 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  46.93 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  42.68 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  43.88 
 
 		 249 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  43.88 
 
 		 249 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  43.88 
 
 		 249 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  43.6 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  43.2 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  46.3 
 
 		 251 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  47.01 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  44.81 
 
 		 254 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  39.68 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  41.41 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  43.46 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  41 
 
 		 238 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  42.67 
 
 		 230 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  43.1 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  44.3 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  43.04 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  43.15 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  46.22 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  43.48 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  43.46 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  43.46 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  41.82 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  46.67 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  44.3 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  41.08 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  42.37 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  43.18 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  43.75 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  42.8 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  39.3 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  41.34 
 
 		 194 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  42.92 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.59 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  64 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  25.88 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  33.9 
 
 		 123 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  19.65 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  29.85 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  26.43 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  25.46 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  25.61 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  24.47 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  24.66 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  29.33 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  26.32 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  27.76 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  25.7 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  38.03 
 
 		 83 aa  45.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  26.87 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  25.63 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  27.23 
 
 		 227 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  24.3 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.98 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  26.43 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  29.36 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  24.77 
 
 		 252 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  33.68 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>