19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1832 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  501  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  93.7 
 
 
260 aa  471  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  69.64 
 
 
254 aa  314  7e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  29.71 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  31 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  24.21 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.82 
 
 
254 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 
250 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  26.67 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  29.96 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  32.26 
 
 
261 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  27.51 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  26.47 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  24.3 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  24.39 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  26.32 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>