53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6050 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
264 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  94.7 
 
 
264 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  70.83 
 
 
282 aa  357  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  65.91 
 
 
309 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5394  hypothetical protein  71.7 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.030733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  27.23 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  26.81 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  30.09 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  30.09 
 
 
250 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 
250 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  29.02 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  27.51 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  27.73 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.66 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3882  hypothetical protein  55.56 
 
 
79 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4487  hypothetical protein  55.56 
 
 
79 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  28.25 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  29.03 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  29.41 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  30.49 
 
 
278 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.47 
 
 
254 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  25.42 
 
 
250 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  29.2 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  26.16 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  30.73 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  27.75 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  31.85 
 
 
250 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  26.5 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  29.78 
 
 
258 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  25.91 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  25.91 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  25.91 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  24.36 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  32.23 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  26.4 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  27.31 
 
 
244 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  27.08 
 
 
267 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  27.05 
 
 
267 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  37.23 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  24.37 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  33.91 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  26.92 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  27.64 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  28.67 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5817  hypothetical protein  52.63 
 
 
59 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  28.44 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>