61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0947 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
250 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  84.36 
 
 
251 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  68.51 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  68.38 
 
 
250 aa  310  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  68.38 
 
 
250 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  59.15 
 
 
243 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  62.33 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  56.97 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  56.97 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  56.97 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  58.8 
 
 
254 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  58.8 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  53.65 
 
 
238 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  61.3 
 
 
258 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  54.94 
 
 
230 aa  234  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  58.8 
 
 
254 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  57.74 
 
 
251 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  56.79 
 
 
267 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  58.26 
 
 
270 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  57.38 
 
 
267 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  56.5 
 
 
246 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  57.02 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  55.09 
 
 
248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  51.71 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  54.7 
 
 
241 aa  221  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  53.65 
 
 
241 aa  221  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  56.28 
 
 
254 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  59.73 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  45.6 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  47.86 
 
 
250 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  47.44 
 
 
261 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  51.64 
 
 
249 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  47.86 
 
 
244 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  56.41 
 
 
278 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  45.69 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  49.78 
 
 
259 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  58.11 
 
 
254 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  51.6 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  51.69 
 
 
258 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  55.87 
 
 
194 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  47.52 
 
 
258 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  46.93 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  43.41 
 
 
256 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  30.95 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  47.62 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  31.33 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  29.17 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  73.08 
 
 
61 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  29.36 
 
 
309 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  26.67 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  55.38 
 
 
83 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  31.74 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  28.39 
 
 
257 aa  55.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  21.86 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  28.5 
 
 
264 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  26.41 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  22.31 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.69 
 
 
247 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  23.08 
 
 
307 aa  42  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>