47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0354 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  94.33 
 
 
250 aa  300  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  61.14 
 
 
254 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  60.62 
 
 
254 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  59.9 
 
 
254 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  58.29 
 
 
251 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  57.29 
 
 
251 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  55.87 
 
 
250 aa  177  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  57.29 
 
 
258 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  54.8 
 
 
270 aa  174  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  55.06 
 
 
250 aa  174  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  54.49 
 
 
250 aa  174  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  53.12 
 
 
241 aa  174  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  51.56 
 
 
241 aa  171  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  51.55 
 
 
249 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  51.55 
 
 
249 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  51.55 
 
 
249 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  49.74 
 
 
243 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  48.44 
 
 
238 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  47.12 
 
 
230 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  56.25 
 
 
254 aa  158  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  53.41 
 
 
248 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  56.18 
 
 
250 aa  154  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  51.03 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  51.3 
 
 
267 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  50 
 
 
267 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  47.18 
 
 
251 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  50 
 
 
267 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  49.48 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  50 
 
 
258 aa  141  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  49.22 
 
 
251 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  43.92 
 
 
244 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  42.33 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  40.96 
 
 
261 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  43.39 
 
 
250 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  41.8 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  53.63 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  47.69 
 
 
278 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  46.07 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  40.74 
 
 
259 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  44.28 
 
 
256 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  41.49 
 
 
258 aa  99  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  38.12 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.53 
 
 
254 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  25.65 
 
 
282 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  31.58 
 
 
249 aa  41.2  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>