63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4352 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  99.2 
 
 		 250 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  94.4 
 
 		 250 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  68.8 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  68.38 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  57.2 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  60.65 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  55.84 
 
 		 254 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  57.14 
 
 		 258 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  55.41 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  49.2 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  55.93 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  48.93 
 
 		 238 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  53.09 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  53.09 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  53.01 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  53.09 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  47.28 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  46.44 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  54.3 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  46.86 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  53.09 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  49.79 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  53.39 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  58.3 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  49.15 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  48.93 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  47.19 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  55.27 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  53.88 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  55.22 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  47.74 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  44.77 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  51.08 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  49.79 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  52.74 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  50 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  51.77 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  54.75 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  49.09 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  41.81 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  41.38 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  47.64 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  31.95 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  40.24 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  30.32 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  72.92 
 
 		 61 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  27.65 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  30.09 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  28.85 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  25.67 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  24.81 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  24.8 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  24.8 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  24.8 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  24.8 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  29.11 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2024  hypothetical protein  26.56 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396668  normal  0.0591457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1932  protein of unknown function DUF81  34.41 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.29 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  24.8 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>