63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2841 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  47.97 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  42.32 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  42.15 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  27.98 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  31.02 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  25.33 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  29.66 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  28.35 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  28.23 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  27.53 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  27.47 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  30.54 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  27.04 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  26.56 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  26.67 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  25.96 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  25.96 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  25.96 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  27.47 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  26.61 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  26.83 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  26.03 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  28.18 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  24.17 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  27.73 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  26.97 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  27.73 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  27.73 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  28.18 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  25.43 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  24.17 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  25.93 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  26.91 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  27.49 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  24.57 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  30.09 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  30.21 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  25.32 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  27.52 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  24.79 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  26.38 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  27.13 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  26.38 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  33.04 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  26.14 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  31.5 
 
 		 246 aa  45.4  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  25.33 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  23.98 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.29 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  28.47 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  27.76 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  34.92 
 
 		 297 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  26.22 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  27.68 
 
 		 174 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>