28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2024 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2024  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  474  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396668  normal  0.0591457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  47.81 
 
 		 232 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  29.63 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  29.63 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  29.63 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  27.33 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  26.56 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  43.33 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  26.81 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  26.03 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  45.1 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  25.76 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  26.45 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  30.35 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  26.79 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  26.48 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  26.14 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  29.39 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  25.84 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  25.12 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  27.68 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  27.76 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  26.82 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  26.78 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>