60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4525 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  98.82 
 
 		 254 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  92.91 
 
 		 254 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  86.22 
 
 		 258 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  67.72 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  67.72 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  58.9 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  57.69 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  63.48 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 		 243 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  57.08 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  57.08 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  57.08 
 
 		 249 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  57.08 
 
 		 250 aa  215  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  61.47 
 
 		 251 aa  214  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  55.2 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  57.34 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  52.36 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  56.42 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  52.84 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  55.08 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  54.85 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  54.85 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  54.62 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  54.43 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  59.09 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  54.01 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  48.54 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  54.35 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  53.42 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  43.6 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  46.41 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  53.39 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  43.88 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  54.7 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  44.96 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  43.4 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  61.67 
 
 		 194 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  43.75 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  49.58 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  50.66 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  47.84 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  47.86 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  75.93 
 
 		 61 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.94 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  46.15 
 
 		 123 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.17 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  31.3 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  54.69 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  29.15 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  25.59 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0531  hypothetical protein  24.58 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  29.13 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  29.13 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  29.13 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  26.61 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  19.31 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  26.61 
 
 		 255 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>