34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5981 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  63.97 
 
 
256 aa  274  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 
247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 
249 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  33.04 
 
 
242 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  37.18 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  34.18 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  33.79 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  33.79 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  34.85 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  34.66 
 
 
250 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  30.12 
 
 
251 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  37.44 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  34.14 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  36.02 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  33.47 
 
 
250 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  30.8 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  36.11 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  28.06 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.37 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  23.89 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.37 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  28.18 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.23 
 
 
240 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  27.65 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  26.24 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  30.06 
 
 
246 aa  42.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  21.99 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  27.63 
 
 
243 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  26.26 
 
 
243 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  28.44 
 
 
297 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>