50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22430 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  46.03 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  43.03 
 
 
253 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  45.04 
 
 
250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  44.44 
 
 
249 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  42.86 
 
 
248 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  46.28 
 
 
270 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  41.74 
 
 
251 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  47.14 
 
 
251 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  43.72 
 
 
249 aa  154  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  45.18 
 
 
253 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  45.18 
 
 
253 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  45.3 
 
 
249 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  43.72 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  37.33 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  36.03 
 
 
250 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  34.11 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  36.28 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  46.4 
 
 
146 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  30.59 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  30.33 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  25.32 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  24.89 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  30.97 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  30.49 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  30.49 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  30.49 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  29.25 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  25.93 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  24.68 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  30.67 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  30.67 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1702  hypothetical protein  31.67 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0934945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  27.76 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  33.63 
 
 
260 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  27.38 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  28.14 
 
 
245 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  33.04 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  20.89 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  31.14 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  24.4 
 
 
262 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  31.14 
 
 
251 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  25.45 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  31.58 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  32.29 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  25.11 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  23.45 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  31.96 
 
 
251 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>