30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2500 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  70.68 
 
 		 253 aa  350  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  71.31 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  69.8 
 
 		 249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  66.4 
 
 		 270 aa  308  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  67.6 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  66.53 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  65.85 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  61.2 
 
 		 251 aa  296  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  66.95 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  72.11 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  47.79 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  37.29 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  48.91 
 
 		 146 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  34.62 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  34.62 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  35.32 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  32.34 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  32.13 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  32.11 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  29.18 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  25.64 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  22.92 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  22.78 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  20.42 
 
 		 246 aa  45.4  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  21.31 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  21.72 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>