41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1865 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  66.27 
 
 		 253 aa  321  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  68 
 
 		 250 aa  321  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  62.9 
 
 		 270 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  63.14 
 
 		 249 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  62.86 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  60.16 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  63.14 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  59.6 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  62.23 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  61.9 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  40.95 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  55 
 
 		 146 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  30.12 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  29.91 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  29.91 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  28.98 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.16 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  27.11 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  28.5 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.59 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.59 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.59 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  24.07 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  27.9 
 
 		 291 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  26.54 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  24.18 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  24.58 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  24.9 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  21.14 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  19.69 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  28.25 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  28.25 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  28.96 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  35.58 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  29.34 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  22.54 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  24.79 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 		 238 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>