38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5622 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  67.07 
 
 		 253 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  69.11 
 
 		 250 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  60.16 
 
 		 251 aa  300  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  64.58 
 
 		 249 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  60.48 
 
 		 270 aa  288  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  63.98 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  63.98 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  65.85 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  59.84 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  65.03 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  44.25 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  36.21 
 
 		 247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  30.51 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  30.51 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  30.8 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  28.87 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  29.31 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  27.75 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  32.92 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  23.51 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  23.63 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  23.5 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  23.75 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  23.73 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 		 272 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  24.79 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  24.23 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  22.36 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  28.07 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  22.27 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  26.67 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  21.29 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25.32 
 
 		 291 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25.32 
 
 		 291 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25.32 
 
 		 291 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>