46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8662 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 256 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  63.97 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  32.29 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  31.86 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  34.89 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  29.86 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  30.7 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  30.7 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  29.58 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  33.18 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  33.87 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  30.23 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  31.97 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  32.74 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  32.23 
 
 		 248 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  30.67 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  39.22 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  39.23 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  23.77 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.03 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  24.07 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  24.07 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  22.94 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  29.56 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  24.66 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  22.36 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  26.52 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  28.48 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  24.02 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  26.67 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  24.02 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  28.95 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.07 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.07 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.07 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  24.24 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  28.02 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  25.52 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  24.5 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  26.24 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  25.57 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  22.46 
 
 		 241 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  26.14 
 
 		 253 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>