31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3972 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  51.69 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  51.69 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  33.76 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  33.47 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  32.63 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  36.44 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  30.09 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  32.11 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  30.29 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  32.5 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  28.87 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  28.98 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  32.92 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  30.84 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  29.69 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  35.21 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  30.52 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  28.93 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  26.92 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  26.2 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  25.2 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  27.72 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  27.59 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  22.58 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  28.24 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2506  hypothetical protein  26.09 
 
 		 239 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000601102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  22.36 
 
 		 247 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>