43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4163 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  485  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  36.91 
 
 
241 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  36.05 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  30.38 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  32.48 
 
 
241 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  33.77 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  33.33 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  92  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  32.48 
 
 
241 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  27.31 
 
 
245 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  26.45 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  23.75 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  24.89 
 
 
262 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  22.67 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  28.86 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  26.28 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  24.37 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  21.83 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  23.68 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  21.3 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  24.05 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  27.12 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  24.54 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  24.9 
 
 
260 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  27.07 
 
 
278 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  26.94 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  23.11 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  25.85 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  26.2 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  26.94 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  26.38 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  24.1 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  26.09 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  21.99 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  21.43 
 
 
245 aa  42  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
267 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>