47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4590 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  78 
 
 		 251 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  76.4 
 
 		 251 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  76.4 
 
 		 251 aa  324  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  75.6 
 
 		 251 aa  321  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  65.42 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  64.88 
 
 		 260 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  51 
 
 		 284 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  46.15 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  48.96 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  45.67 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  42.16 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  39.91 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  38.82 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  29.18 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  32.44 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  32.44 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.8 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  29.6 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  29.22 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  23.21 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1447  hypothetical protein  76.47 
 
 		 62 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  32.23 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  32.49 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  26.42 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  25.94 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  31.74 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  28.51 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  27.39 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  27.39 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  27.39 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  25 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  26.18 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  27.14 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  26.63 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  27.94 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  26.81 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  34.69 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  30.89 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  34.64 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 		 237 aa  42.4  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  27.16 
 
 		 253 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  27.16 
 
 		 253 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>